Научноистраживачка делатност Института реализује се кроз четири одељења која обједињују сродне научне области.
Одељења су носиоци научноистраживачких активности у областима: језика и књижевности, историје, права и политикологије, као и историје уметности, етнологије, археологије и културологије.